Estos protocolos han sido elaborados en el marco del proyecto Con Buena Razón: lucha y prevención de las formas más degradantes, crueles e inhumanas de tortura y otros malos tratos hacia la población privada de libertad, particularmente mujeres y adolescentes, de Bolivia y Honduras, financiado por la Unión Europea y en consorcio con la Defensoría del Pueblo, Progettomondo y el Instituto de Terapia e Investigación sobre las Secuelas de la Tortura y  Violencia Estatal (ITEI), y trabajado con la conformación de subcomisiones interinstitucionales de revisión de propuestas para la definición de protocolos y reglamentos de actuación para la atención, denuncia e investigación de casos de tortura y malos tratos, bajo la organización y experticia del ITEI.